- Пространственная транскриптомика — современный метод, позволяющий ученым оценить активность генов и совокупность их сложных молекулярных взаимодействий с учетом глубокого понимания пространственной организации клеток в образце ткани.
Участниками школы стали представители научных и медицинских организаций из разных регионов России: Университет «Сириус», Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Башкирский государственный медицинский университет, Институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича, НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина и др.
- Проведенная школа важна не только для молодых ученых, которые под руководством опытных коллег смогли освоить сложный метод, но и для врачей, и для наших пациентов. Новые исследовательские подходы, расширение возможностей науки дает больше возможностей и для клинической практики, открывает перспективы для поиска ранее неизвестных диагностических маркеров, мишеней для терапии. Это позволит нам приблизиться к разработке более эффективных методов лечения онкозаболеваний, - подчеркнул Евгений Чойнзонов, академик РАН, врио директора НИИ онкологии Томского НИМЦ.
В течение интенсивного четырехдневного практикума участники школы под руководством модераторов - представителей лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ и китайских компаний MGI и Helicon освоили сложнейшую технологию Stereo-seq на образце опухолевой ткани.
.jpg)
- Это технология, позволяющая исследовать транскриптом тканей, органов или организмов с пространственным разрешением и на уровне единичных клеток, - прокомментировал заведующий лабораторией биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ, д-р биол. наук Евгений Денисов. Он уточнил, что применение технологии дает возможность создания прочной исследовательской базы для глубокого понимания взаимосвязи между экспрессией (активностью) генов, морфологией клеток и клеточным микроокружением.
Представитель компании MGI Chris Chen отметил, что главное преимущество представленного подхода - высокое разрешение и возможность анализировать образцы большого размера (13х13 см).
- Я интересуюсь омиксными технологиями, занимаюсь как эндо- так и экзометаболомикой. Одна из моих последних работ посвящена анализу различных первичных культур клеток глаза. Также, одно из направлений нашего коллектива – метаболомный скрининг различных микроорганизмов, которые могут применяться в биотехнологии. Для меня участие в Школе – возможность освоить пока что малознакомый метод, - поделилась участница школы Мария Сотникова (Новосибирский институт органической химии им. Н.Н. Ворожцова СО РАН, лаборатория физиологически активных веществ).
- Мы собрали активных участников, которые были вовлечены в технологию от начала и до конца школы. Четырехдневный интенсив прошёл с прямым участием специалистов в области технологии Stereo-seq. Участники получили уникальные знания в практических аспектах пробоподготовки, создания пространственных РНК-библиотек и последующего секвенирования, - рассказала сопредседатель Оргкомитета школы, младший научный сотрудник лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ Анастасия Коробейникова. Она поблагодарила участников школы, партнёров и членов оргкомитета.
- Организаторы школы: ASCA, Томский НИМЦ, компании MGI и Helicon
