Обычная версия сайта:
Размер шрифта:
a
a
a
Языковая версия:
en
Перейти на сайт Томского НИМЦ

Научно-практическая школа “Секвенирование единичных клеток”. 30 ноября - 4 декабря 2020 г.

День 1-й

Григорий Аникин, SkyGen. Новые решения 10x Genomics для анализа одиночных клеток и пространственной экспрессии генов





Алексей Аникаев, QIAGEN Russia. Введение в технологию секвенирования QIAseq FX Single Cell RNA seq





Наталья Бочарова, BD Biosciences. Введение в технологию высокопроизводительного анализа экспрессии белков и РНК на уровне отдельных клеток BD Rhapsody






Практикум BD Rhapsody Single Cell Analysis





Практикум QIAseq FX Single Cell RNA seq








Практикум 10x Genomics single cell RNA seq








День 2-й


Практикум BD Rhapsody Single Cell Analysis (продолжение)






Практикум QIAseq FX Single Cell RNA seq (продолжение)





Практикум 10x Genomics single cell RNA seq (продолжение)




День 3-й

Мини-конференция "Опыт секвенирования единичных клеток"

  Евгений Денисов, Томский НИМЦ, Томск. Секвенирование отдельных клеток. Новая система секвенирования NextSeq 2000





Марина Патышева, Томский НИМЦ, Томск. Характеристика циркулирующих моноцитов пациентов с колоректальным раком на основе данных секвенирования единичных клеток





Максим Меняйло, Томский НИМЦ, Томск. Опыт секвенирования циркулирующих клеток рака молочной железы







Mohit Kumar Jolly, Indian Institute of Science, India. Probing underlying mechanisms and implications of single-cell heterogeneity in tumor








 Иван Козлов, Институт иммунологии ФМБА России, Москва. Молекулярное баркодирование как новый метод изучения функции Т-лимфоцитов на уровне единичных клеток





Петр Тюрин-Кузьмин, МГУ имени М.В. Ломоносова, Москва. Использование 10х single cell RNAseq для выяснения особенностей гормональной регуляции постнатальных стволовых клеток человека






Олег Шпынов, JetBrains Research. Understanding single cell ATAC-seq data







Виктор Петухов, University of Copenhagen, Denmark. Case-control analysis of single-cell RNA-seq studies






Gema Fuerte, European Field Application Scientist, Mission bio.  Multi-omic SNV, CNV  and protein sequencing from thousands of single cells




День 4-й

Биоинформатический анализ данных секвенирования единичных клеток

Алексей Сергушичев, Университет ИТМО, Санкт-Петербург. Обработка сырых данных, Контроль качества данных







Алексей Сергушичев, Университет ИТМО, Санкт-Петербург. Визуальный анализ данных РНК сек, phantasus







Алексей Аникаев, QIAGEN Russia. Обзор биоинформатических решений QIAGEN








День 5-й

Биоинформатический анализ данных секвенирования единичных клеток

  Константин Зайцев, Университет ИТМО, Санкт-Петербург. Введение в секвенирование РНК одиночных клеток








Константин Зайцев, Университет ИТМО, Санкт-Петербург. Базовый анализ данных экспрессии одиночных клеток








Константин Зайцев, Университет ИТМО, Санкт-Петербург. Интерпретация результатов дифференциальной экспрессии одиночных клеток








Константин Зайцев, Университет ИТМО, Санкт-Петербург. Визуальный анализ экспрессии одиночных клеток в scNavigator






Константин Зайцев, Университет ИТМО, Санкт-Петербург. Введение в анализ траекторий дифференцировки, pseudo-time, RNA-velocity