Бабышкина Наталия Николаевна
Бабышкина Наталия Николаевна, доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной онкологии и иммунологии НИИ онкологии Томского НИМЦ.
Контактная информация
e-mail: nbabyshkina@mail.ru
тел.: 8 (3822) 28-26-76 доп 3340
факс: 8 (3822) 51-40-97
ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Nataliya_Babyshkina
РИНЦ: SPIN-код: 2738-9275, AuthorID: 183828
ResearcherID Web of Science: A-7526-2012
Scopus (Author ID): 26641099700
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-0562-3878
Краткая биография
Бабышкина Наталия Николаевна в 1996 году с отличием окончила медико-биологический факультет Сибирского медицинского университета по специальности «биохимия». В 1996 году принята на должность лаборанта-исследователя в лабораторию иммунологии НИИ онкологии. С 2000 года являлась младшим научным сотрудником, а с 2007 года – научным сотрудником лаборатории иммунологии НИИ онкологии. В 2005 году успешно защитила кандидатскую диссертацию по специальностям «онкология» и «патологическая физиология». В 2009-2010 гг. Н.Н. Бабышкина по гранту Австрийского противоракового общества выполняла научно-исследовательскую работу в Медицинском университете г. Инсбрук, Австрия. С 2012 года Н.Н. Бабышкина осуществляет руководство Биобанком НИИ онкологии. С 2013 года является старшим научным сотрудником лаборатории молекулярной онкологии и иммунологии НИИ онкологии Томского НИМЦ.В 2019 году успешно защитила докторскую диссертацию «Прогностическая и предсказательная значимость молекулярно-генетических маркеров, ассоциированных с PI3K/Akt/mTOR- сигнальным путем при раке молочной железы» по специальности «онкология». С 2020 года по настоящее время является доцентом кафедры биохимии и молекулярной биологии с курсом клинической лабораторной диагностики СибГМУ. С октября 2022 года - ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной онкологии и иммунологии НИИ онкологии Томского НИМЦ.
Область научных интересов
Н.Н. Бабышкина является автором более 100 печатных работ, трех российских патентов на изобретение и четырех свидетельств о государственной регистрации программных продуктов.
Областью её научных интересов является изучение патогенеза и закономерностей биологического поведения молекулярных подтипов рака молочной железы и колоректального рака.
Основные научные исследования Н.Н. Бабышкиной связаны с поиском генетических маркеров терапевтической неэффективности и прогноза разных молекулярно-генетических вариантов злокачественных новообразований, разработкой методологии индивидуализации терапии рака молочной железы и колоректального рака на основе молекулярно-генетического анализа.
Достижения, награды, гранты
Н.Н. Бабышкина принимает активное участие в разработке и выполнении основных тематик научных проектов, контрактов и договоров лаборатории молекулярной онкологии и иммунологии.
Является активным исполнителем Интеграционного научного проекта СО РАМН «Молекулярно-генетические механизмы формирования и прогрессии рака молочной железы: разработка критериев риска, прогноза клинического течения и чувствительности к химиотерапии на основании выявления информативных маркеров опухоли и организма» (2006-2008 гг); научно-исследовательской темы «Разработка новых критериев прогнозирования отдаленных метастазов на основе выявления комплекса молекулярно-генетических и морфологических маркеров злокачественного процесса с целью определения адекватной тактики и повышения эффективности лечения больных раком молочной железы» в рамках подпрограммы «Онкология» федеральной целевой программы «Предупреждение и борьба с социально значимыми заболеваниями (2007-2011гг); Гранта РФФИ № 09-04-13409 «Опыт и перспективы развития сотрудничества между российскими и тайваньскими учеными в области изучения молекулярно-генетических механизмов развития злокачественных новообразований и использования результатов фундаментальных исследований в онкологии» (2009г); Гранта РФФИ № 15-54-79001 «Проект организации международного семинара в области молекулярной биологии «Клеточные и молекулярные механизмы взаимоотношения опухоли и микроокружения» (2015г); проекта ВИУ «Поиск биомаркеров и терапевтических мишеней в процессах хронического воспаления, связанного с прогрессией злокачественных новообразований, регенеративными процессами сердечно-сосудистых заболеваний и имплантологией» в рамках Программы повышения конкурентоспособности ТГУ (2016-2020 гг); гранта РФФИ № 17-29-06037 офи_м «Геномные механизмы регуляции опухолевой прогрессии рака молочной железы в условиях лекарственной терапии» (2017-2020 гг); гранта РНФ № 19-75-30016 «Новая технология прогнозирования и профилактики отдаленного метастазирования на основе детекции циркулирующих метастаз-инициирующих и нишеобразующих клеток и их специфических мишеней» (2019-2022 гг).
Н.Н. Бабышкина является обладателем Гранта в области медицины и междисциплинарных областей знаний в номинации «Клиническая медицина», присужденным Региональным общественным фондом содействия отечественной медицине Президиума Российской академии медицинских наук (2008г): гранта Канадского Фонда по раку молочной железы для участия в V Всемирной конференции по раку молочной железы, Виннипег (2008г); гранта Европейского общества медицинских онкологов (ESMO) для участия в I Европейской конференции по раку молочной железы, Бельгия, Брюссель (2009г);гранта Европейской противораковой организации (EBCC) для участия в VII европейской конференции по раку молочной железы, Испания, Барселона (2010г); гранта Европейской организации по исследованию и лечению рака (EORTC) для участия в 22ом EORTC-NCI-AACR симпозиуме «Молекулярные мишени и лечение рака», Германия, Берлин (2010г).
В 2011 году Н.Н. Бабышкиной получен Грант № SG-BCC 2011-G/1022-8 международного научного комитета 12-й Международной конференции по раку молочной железы в Санкт-Галлене; в 2011-2015 годах - Гранты Curiline/AACR для участия в ежегодных международных симпозиумах AACR-NCI-EORTC, Сан-Франциско (2011), Сан-Диего (2014), Бостон (2015).
Н.Н. Бабышкина является лауреатом премии Томской области в сфере образования, науки, здравоохранения и культуры (2019 г), имеет благодарственное письмо Администрация г. Томска “За многолетний добросовестный труд, заслуги в области науки и медицины, охраны здоровья и жизни населения” (2019 г) и благодарность Совета ректоров вузов Томской области “За значительный вклад в развитие научно-образовательного потенциала Томской области” (2020 г).
Н.Н. Бабышкина – член Американской ассоциации по исследованию рака (AACR) и Европейского общества медицинских онкологов (ESMO).
Избранные публикации
1. Дронова Т.А., Бабышкина Н.Н., Матвиенко Н.В., Слонимская Е.М., Чердынцева Н.В. PI3K/AKT/MTOR: вклад в формирование фенотипа опухоли, чувствительного к тамоксифену. Российский биотерапевтический журнал. - 2021. – Т.20(1). – С. 16-23 . Doi:10.17650/1726-9784-2021-20-1-16-23
2. Dronova T A, Babyshkina N N, Zavyalova M V , Slonimskaya E M, Cherdyntseva N V. (2021) Vascular Endothelial Growth Factor Receptor 2 (VEGFR2) Contributes to Tamoxifen Resistance in Estrogen-Positive Breast Cancer Patients. Mol Biol. 55(1):118-125. doi: 10.31857/S0026898421010055.
3. Gervas P, Molokov A, Schegoleva A, Kiselev A, Babyshkina N, Pisareva L, TyukalovY, Choynzonov E, Cherdyntseva N. (2020) New germline mutations in non-BRCA genes among breast cancer women of mongoloid origin. Molecular Biology Reports. 47(7): 5315-5321. doi: 10.1007/s11033-020-05612-2.
4. Babyshkina N.N., Dronova T.A., Zambalova E.A., Zavyalova M.V., Slonimskaya E.M., Cherdyntseva N.V. The role of epidermal growth factor receptor (EGFR) in the efficacy of neoadjuvant chemotherapy in triple-negative breast cancer patients. Bulletin of Siberian Medicine. 2020; 19 (1): 13–20. https://doi.org: 10.20538/1682-0363-2020-1-13–20.
5. Эрдынеева Д.Б., Бабышкина Н.Н., Дронова Т.А., Вторушин С.В., Слонимская Е.М., Стегний В.Н., Чердынцева Н.В. Роль циклина D1 в механизмах резистентности к гормональной терапии тамоксифеном /Сибирский онкологический журнал. – 2020. – Т.19, № 4.- С. 138–145. doi: 10.21294/1814-4861-2020-19-4-138-145.
6. Babyshkina N, Vtorushin S, Dronova T, Patalyak S, Slonimskaya E, Kzhyshkowska J, Cherdyntseva N, Choynzonov E.(2019) Impact of estrogen receptor α on the tamoxifen response and prognosis in luminal-A-like and luminal-B-like breast cancer. Clin Exp Med. 2019 Nov;19(4):547-556. DOI: 10.1007/s10238-019-00583-6.
7. Дронова Т. А., Бабышкина Н. Н., Завьялова М. В., Паталяк С. В., Слонимская Е. М., Чердынцева Н. В., Кжышковска Ю. Г. Взаимосвязь компонентов EGFR/PI3K/AKT-сигнального пути с эффективностью терапии тамоксифеном у больных эстрогензависимым раком молочной железы. Успехи молекулярной онкологии. - 2018. - № 5 (3). - С.40-50. https://doi.org/10.17650/2313-805X-2018-5-3-40-50.
8. Babyshkina N, Zavyalova M, Tarabanovskaya N, Dronova T, Krakhmal N, Slonimskaya E, Kzhyshkowska J, Choynzonov E, Cherdyntseva N. (2018) Predictive value of vascular endothelial growth factor receptor type 2 in triple-negative breast cancer patients treated with neoadjuvant chemotherapy. Mol Cell Biochem. 444(1-2):197-206. doi: 10.1007/s11010-017-3244-1.
9. Babyshkina N, Vtorushin S, Zavyalova M, Patalyak S, Dronova T, Litviakov N, Slonimskaya E, Kzhyshkowska J, Cherdyntseva N, Choynzonov E. (2017) The distribution pattern of ERα expression, ESR1 genetic variation and expression of growth factor receptors: association with breast cancer prognosis in Russian patients treated with adjuvant tamoxifen. Clin Exp Med. Aug;17(3):383-393. doi: 10.1007/s10238-016-0428-z.
10. N. Babyshkina, M. Zavyalova, S. Patalyak, T. Dronova, E. Slonimskaya, and N. Cherdyntseva. (2017) Non-Smad TGF-β signaling components are possible biomarkers of tamoxifen resistance. AIP Conference Proceedings 1882, 020003. doi: 10.1063/1.5001582
11. Бабышкина Н.Н., Завьялова М.В., Брагина О.Д., Дронова Т.А., Слонимская Е.М., Чердынцева Н.В. Оценка предсказательной значимости рецептора сосудистого эндотелиального фактора роста VEGFR-2 у больных тройным негативным раком молочной железы. Сибирский онкологический журнал. -2016. - № 15(5). – С. 9-17. DOI:10.21294/1814-4861-2016-15-5-9-17
12. N. Babyshkina, S. Vtorushin, S. Patalyak, T. Dronova, E. Slonimskaya, N.Cherdyntseva. Prognostic significance of immunohistochemical and genetic markers in Russian breast cancer patients treated with adjuvant tamoxifen (2015) Proceeding of EJC SUPPLEMENTS, 13: 2-3. http://dx.doi.org/10.1016/j.ejcsup.2015.08.003
13. Nataliya Babyshkina, Sergey Vtorushin, Stanislav Patalyak, Tatyana Dronova, Elena Slonimskaya, Nadejda Cherdyntseva. The distribution pattern of ERα expression, VEGFR2 expression level and its genetic variation as potential biomarkers for tamoxifen resistance (2015) Proceedings of Mol Cancer Ther 14(12) Suppl 2. DOI: 10.1158/1535-7163.TARG-15-A26
14. Babyshkina N, Malinovskaya E, Patalyak S, Bragina O, Tarabanovskaya N, Doroshenko A, Slonimskaya E, Perelmuter V, Cherdyntseva N. (2014) Neoadjuvant chemotherapy for different molecular breast cancer subtypes: a retrospective study in Russian population. Medical Oncology. Sep;31(9):165. DOI: 10.1007/s12032-014-0165-7
15. Слонимская Е. М.. Вторушин С. В., Бабышкина Н. Н., Паталяк С. В. Роль морфологических и генетических особенностей строения рецепторов эстрогенов альфа в развитии резистентности к эндокринотерапии тамоксифеном у пациенток с люминальным раком молочной железы // Сибирский онкологический журнал. – 2014. - № 3. – С. 39-44.
16. Паталяк С.В., Слонимская Е.М., Вторушин С.В., Бабышкина Н.Н., Перельмутер В.М., Завьялова М.В., Чурилова Л.А., Бахарев С.Ю. Влияние характера распределения рецепторов эстрогенов альфа и их индивидуальных генетических особенностей на эффективность эндокринотерапии тамоксифеном у пациенток с люминальным типом рака молочной железы // Врач-аспирант. – 2014. - Т. 62, № 1.3. С. 423-427.
17. Babyshkina N, Malinovskaya E, Nazarenko M, Koval M, Gervas P, Potapova O, Slonimskaya E, Cherdyntseva N. (2013) The effect of folate-related SNPs on clinicopathological features, response to neoadjuvant treatment and survival in pre- and postmenopausal breast cancer patients. Gene. 518:397-404. doi: 10.1016/j.gene.2012.12.095.
18. Шевченко А.В., Коненков В.И., Бабышкина Н.Н., Савенкова О.В., Слонимская Е.М. Анализ ассоциаций полиморфизма гена VEGF-Aв позициях -2578A/C и +936C/T с разным рецепторным статусом у больных раком молочной железы. железы // Сибирский онкологический журнал – 2013. –– № 1.– С.32-37.
19. Кухарев Я.В., Стахеева М.Н., Дорошенко А.В., Литвяков Н.В., Бабышкина Н.Н., Слонимская Е.М., Чердынцева Н.В. Связь иммунологических показателей с эффективностью неоадъювантной химиотерапии у больных раком молочной железы. // Сибирский онкологический журнал – 2013. –– № 2.– С.50-57.
20. Denisov E.V., Cherdyntseva N.V., Litvyakov N.V., Malinovskaya E.A., Babyshkina N.N., Belyavskaya V.M., Voevoda M.I. (2012) TP53 gene polymorphisms in cancer risk: The modulating effect of ageing, ethnicity and TP53 somatic abnormalities. Tumor Suppressor Genes. P.Y. Cheng (ed), (InTech).Rijeka, Croatia, 79-110.
21. Cherdyntseva NV, Denisov EV, Litviakov NV, Maksimov VN, Malinovskaya EA, Babyshkina NN, Slonimskaya EM, Voevoda MI, Choinzonov EL. (2012) Crosstalk between the FGFR2 and TP53 genes in breast cancer: data from an association study and epistatic interaction analysis. DNA Cell Biol. 31:306-16. DOI: 10.1089/dna.2011.1351
22. Babyshkina N.N, Malinovskaya E.A, Stakheyeva M.N, Volkomorov V.V, Cherdyntseva N.V, Slonimskaya E.M. (2011) Association of functional polymorphism in the TGFβ1-509C>T gene with infiltrating ductal breast carcinoma risk in a Russian population. Cancer Epidemiol. 35 560–563. DOI: 10.1016/j.canep.2011.02.002
23. Babyshkina N.N, Malinovskaya E.A, Zavyalova M.V, Cherdyntseva N.V, Slonimskaya E.M. (2011) Molecular breast cancer subtypes: relationship with clinicopathological characteristics, efficacy of neoadjuvant chemotherapy and survival // The Breast Supplement 1. S41.
24. Babyshkina N.N, Malinovskaya E.A, Stakheyeva M.N, Volkomorov V.V, Ufandeev A.A., Slonimskaya E.M. (2010) Role of the transforming growth factor-beta1 in breast cancer pathogenesis. Siberian Oncology Journal 6: 63-70.
25. Babyshkina N.N, Gulyaeva L.F, Malinovskaya E.A, Ivanova A.A, Cherdyntseva N.V, Slonimskaya E.M. (2010) Genetic polymorphisms of transforming growth factor-beta1 and estrogen metabolizing enzyme in estrogen receptor-positive and -negative infiltrating ductal breast carcinoma. Proceeding of European Journal of Cancer Supplements, 8(7): 197.
26. Babyshkina N.N, Gulyaeva L.F, Malinovskaya E.A, Stakheyeva M.N, Cherdyntseva N.V, Slonimskaya E.M. (2010) Estrogen metabolism genes and transforming growth factor beta1 gene polymorphisms in estrogen receptor-positive and –negative infiltrating ductal breast carcinoma. Proceeding of Annals of Oncology, 21(4): 54.
27. Babyshkina N.N, Shevchenko A.V, Salakhutdinova M.Yu, Maximov V.N, Cherdyntseva N.V, Slonimskaya E.M. (2010) The prognostic value of angiogenesis genes polymorphisms in women with infiltrating ductal breast carcinoma. Proceeding of European Journal of Cancer Supplements, 8(34): 108.
28. Babyshkina N.N, Maximov V.N, Voevoda M.I, Salakhutdinova M.Yu, Konenkov V.I, Malinovskaya E.A, Stakheyeva M.N, Cherdyntseva N.V, Slonimskaya E.M. (2009) Association of polymorphisms of angiogenesis genes with infiltrating ductal breast carcinoma. Tomsk Region and Taiwan: Experience of Scientific – Technical and Innovation Cooperation. Proceeding of Siberian-Taiwan Forum 16-17 September, Tomsk pp. 97-99.
29. Babyshkina N.N, Malinovskaya E.A, Stakheyeva M.N, Cherdyntseva N.V, Slonimskaya E.M. (2009) Association of TP53 (Arg72Pro), CCR5 (del32) and TGFB1- 509C>T gene polymorphism and their combinations with breast cancer risk and pathologic response after neoadjuvant chemotherapy. Proceeding of Annals of Oncology, 20(2): 1139.
30. Гервас П.А., Литвяков Н.В., Стахеева М.Н., Миллер С.В., Добродеев А.Ю., Гарбуков Е.Ю., Бабышкина Н.Н., Кухарев Я.В., Васильева М.В., Слонимская Е.М., Белявская В.А., Тузиков С.А., Чердынцева Н.В. (2009) Влияние полиморфизма генов апоптоза и репарации на эффективность неоадъювантной химиотерапии злокачественных новообразований // Сибирский медицинский журнал – 2009. –– Т.34, № 4.– С.41-47.
31. Babyshkina N., Shevchenko A., Cherdyntseva N., Slonimskaya E. (2009) TGFB1– 509C>T and IL10–92C>A polymorphic variants in relationship to breast cancer progression and response to neoadjuvant chemotherapy. Proceeding of European Journal of Cancer, 7(4): 11-12.
32. Perelmuter V.M, Zavyalova M.V, Vtorushin S.V, Slonimskaya E.M, Kritskay N.G, Garbukov E.Yu, Litvyakov N.V, Stakheyeva M.N, Babyshkina N.N, Malinovskaya E.A, Denisov E.V, Lebedev I.N, Nazarenko M.S, Sennikov S.V, Goreva E.P, Kozlov V.A, Voevoda M.I, Maksimov V.N, Belyavskya V.A, Cherdyntseva N.V. (2008) Genetic and clinicopathologic characteristics in premenopausal and menopausal breast cancer patients. Progress gerontology 4: 643-654.