Персоналии

Слепцов Алексей Анатольевич

Слепцов Алексей Анатольевич, кандидат медицинских наук, научный сотрудник лаборатории популяционной генетики Научно-исследовательского института медицинской генетики Томского НИМЦ.

Контактная информация

e-mail: alexei.sleptcov@medgenetics.ru
тел. 8 (3822) 51-72-72

Краткая биография

Слепцов А.А. в 2004 г. окончил Медицинский институт Северо-Восточного федерального университета им. М.К. Аммосова (СВФУ). Во время обучения в университете проводил научные исследования по организации неонатального скрининга в Республике Саха (Якутия) и активно участвовал в студенческих научно-практических конференциях. В 2010 г. окончил клиническую ординатуру в НИИ медицинской генетики по специальности «врач-генетик». Во время прохождения ординатуры активно занимался научными исследованиями и участвовал в различных научно-практических конференциях. В 2015 г. окончил аспирантуру в НИИ медицинской генетики. Успешно защитил кандидатскую диссертацию в 2018 г. на тему «Структурная вариабельность генома при болезнях сердечно-сосудистого континуума».

Область научных интересов

Основная область исследований Слепцова А.А. связана с изучением структурной вариабельности генома при возраст-ассоциированных многофакторных заболеваниях на примере сердечно-сосудистого континуума. Слепцов А.А. имеет опыт экспериментальной работы по исследованию генетических основ моногенных заболеваний и подверженности к многофакторным заболеваниям. Владеет современными методами молекулярно-генетических исследований, в том числе и с применением постгеномных технологий (тандемной масс-спектрометрии, микрочипы и массовое параллельное секвенирование), а также занимается биоинформатической обработкой больших массивов данных. Работы, в которых Слепцов А.А. являлся ответственным исполнителем, поддержаны грантами различных фондов ФЦП, РФФИ, РНФ и Президента Российской Федерации.

Достижения, награды, гранты

Основная область исследований Слепцова А.А. связана с изучением структурной вариабельности генома при возраст-ассоциированных многофакторных заболеваниях на примере сердечно-сосудистого континуума. Слепцов А.А. имеет опыт экспериментальной работы по исследованию генетических основ моногенных заболеваний и подверженности к многофакторным заболеваниям. Владеет современными методами молекулярно-генетических исследований, в том числе и с применением постгеномных технологий (тандемной масс-спектрометрии, микрочипы и массовое параллельное секвенирование), а также занимается биоинформатической обработкой больших массивов данных. Работы, в которых Слепцов А.А. являлся ответственным исполнителем, поддержаны грантами различных фондов ФЦП, РФФИ, РНФ и Президента Российской Федерации.

Достижения, награды, гранты

Помимо научно-педагогической деятельности соискатель занимается разработкой научных и научно-просветительских компьютерных программ. Владеет такими языками программирования как R, java, perl, PLINK, node.js. Проходил онлайн-курсы по программированию в Code School, Coursera, Stepik, а также обучался в Институте биоинформатики (г. Санкт-Петербург). Слепцов А.А. разработал научный проект GenPlex для молодых ученых, а также научно-просветительский проект GenomeGarden для студентов медико-биологических ВУЗов (https://vk.com/genomegarden, https://facebook.com/genomegarden). Разработанная соискателем генетическая программа GeneticScrolls активно используется в научно-исследовательских и диссертационных работах. Слепцов А.А. участвует в научно-просветительской работе среди школьников Томской области на базе Муниципального образовательного учреждения дополнительного образования детей Дворец творчества детей и молодежи (г. Томск).

Результаты научных исследований Слепцова А.А. представлены в виде устных и постерных докладов на более чем 30 отечественных и международных научных съездах и конференциях. Слепцов А.А. является автором более 30 статей в российских и зарубежных журналах (таких как «Генетика», «Молекулярная Биология», “PLoS ONE”), а также одного учебно-методического пособия «Генетические аспекты атеросклероза». За достигнутые успехи в научной и научно-просветительской работе неоднократно награждался дипломами и грамотами. Исследования Слепцова А.А. отмечены премией Международной академической издательской компании «Наука/Интерпериодика» за лучшую публикацию (2013 г.). Кроме того, дважды удостоен стипендии Президента Российской Федерации в 2013 и 2016 гг. 

Член сообществ:

European Society of Cardiology (ESC) – с 2019 г.

American Association for the Advancement of Science (AAAS) – c 2018 г.

Human Genome Organisation (HUGO) – c 2018 г.

European Human Genetics Society (ESHG) – c 2014 г.

European Atherosclerosis Society (EAS) – с 2016 г.

авиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС) – с 2014 г.

Российского общества медицинских генетиков (РОМГ) – с 2015 г.

Национального общества по изучению атеросклероза (НОА) – с 2016 г.

Список публикации

1.      Слепцов А.А. , Назаренко М. С., Зайцева А. В., Казанцев А. Н., Бурков Н. Н., Барбараш О. Л., Пузырев В. П. Cоматический мозаицизм и структурная вариабельность гена GBP3 при атеросклерозе. Атеросклероз. 2019. Т. 15. № 4. С. 46-51.  https://doi.org/10.15372/ATER20190404

2.      Sleptcov A.A., Nazarenko MS, Kazantsev AN, Burkov NN, Skryabin NA, Krakhmal NV, Tashireva LA, Denisov EV, Lebedev IN, Barbarash OL, Puzyrev VP. Genome-wide copy number profiling of atherosclerotic plaques, European Heart Journal. 2019. V 40, I_Supp. 1. ehz747.0323. https://doi.org/10.1093/eurheartj/ehz747.0323

3.      Слепцов А.А., Назаренко М.С., Скрябин Н.А., Казанцев А.Н., Барбараш О.Л., Пузырев В.П. Спектр структурных вариаций генома у больных с ишемической болезнью сердца // Медицинская генетика. 2018. Т.17. №3 (189). C.30-33. 

4.      Назаренко М.С., Марков А.В., Слепцов А.А., Королёва Ю.А., Шарыш Д.В., Зарубин А.А., Валиахметов Н.Р., Гончарова И.А., Пузырев В.П., Муслимова Э.Ф., Панфилов Д.С., Козлов Б.Н., Афанасьев С.А. Сравнительный анализ экспрессии генов в клетках сосудов у больных с клинически выраженным атеросклерозом // Биомедицинская химия. 2018 (в печати). 

5.      Слепцов А.А., Назаренко М.С., Пузырев В.П. Структурная вариабельность генома лейкоцитов и клеток артерий при атеросклерозе у человека. Российский кардиологический журнал. 2017;(10):140-146. DOI:10.15829/1560-4071-2017-10-140-146 

6.      Nazarenko M.S., Sleptcov A.A., Lebedev I.N., Skryabin N.A., Markov A.V., Golubenko M.V., Koroleva I.A., Kazancev A.N., Barbarash O.L., Puzyrev V.P. Genomic structural variations for cardiovascular and metabolic comorbidity. Sci Rep. 2017 Jan 25;7:41268. doi:10.1038/srep41268.  

7.      Назаренко М.С., Слепцов А.А., Марков А.В., Пузырев В.П. Вариабельность генома соматических клеток при многофакторных заболеваниях человека //  Медицинская генетика. 2017. Т.16. № 12 (186). С. 4-8. 

8.      Голубенко М.В., Тарасенко Н.В., Макеева О.А., Гончарова И.А., Марков А.В., Слепцов А.А., Комар А.А., Назаренко М.С., Барбараш О.Л., Пузырев В.П. Полиморфизм мтДНК при клинически выраженном каротидном атеросклерозе: протективный эффект гаплогруппы J. Медицинская генетика. 2017. Т. 16. №10. С. 26-28. 

9.      Назаренко М.С., Марков А.В., Королева Ю.А., Слепцов А.А., Казанцев А.Н., Барбараш О.Л., Пузырев В.П. Идентификация дифференциально метилированных генов, потенциально связанных с атеросклерозом у человека. Российский кардиологический журнал. 2017;(10):42-48. DOI:10.15829/1560-4071-2017-10-42-48 

10.   Denisov EV, Skryabin NA, Gerashchenko TS, Tashireva LA, Wilhelm J, Buldakov MA, Sleptcov AA, Lebedev IN, Vtorushin SV, Zavyalova MV, Cherdyntseva NV & Perelmuter VM. Clinically relevant morphological structures in breast cancer represent transcriptionally distinct tumor cell populations with varied degrees of epithelial-mesenchymal transition and CD44+CD24- stemness. Oncotarget. 2017 May 19. 

11.   Слепцов А.А., Назаренко М.С., Барбараш О.Л., Пузырев В.П. Вариации числа копий гена ERLIN1 у больных с ишемической болезнью сердца. Медицинская генетика. 2016. Том15, №5 (167) С.42-44  

12.   М. В. Голубенко, М. С. Назаренко, А. В. Фролов, А. А. Слепцов,А. В. Марков, М. Е. Глушкова, О. Л. Барбараш, В. П. Пузырев. Анализ гетероплазмии в главной некодирующей области митохондриальной ДНК в крови и атеросклеротических бляшках сонных артерий. // Генетика. 2016, том 52, № 4, с. 497-502  

13.   И.А. Гончарова, О.А. Макеева, М.В. Голубенко, А.В. Марков, Н.В. Тарасенко, А.А. Слепцов, В.П. Пузырев. Гены фиброгенеза в детерминации предрасположенности к инфаркту миокарда // Молекулярная биология. 2016, том 50, № 1, с. 94–10  

14.   Nazarenko MS, Markov AV, Lebedev IN, Freidin MB, Sleptcov AA, Koroleva IA, Frolov AV, Popov VA, Barbarash OL, Puzyrev VP. A comparison of genome-wide DNA methylation patterns between different vascular tissues from patients with coronary heart disease // PLoS One. 2015, 10(4):e0122601. 

15.   Слепцов А.А., Кашеварова А.А., Толмачева Е.Н., Фролов А.В., Попов А.В., Барбараш О.Л., Барбараш Л.С. Феномен парадоминантного наследования при атеросклерозе // Медицинская генетика. 2014 - №10 - С.41-48  

16.   Назаренко М.С., Марков А.В., Королёва Ю.А., Лебедев И.Н., Слепцов А.А., Фролов А.В., Барбараш О.Л., Пузырёв В.П. Статус метилирования генов контроля клеточного цикла в тканях сонных артерий у больных атеросклерозом // Якутский медицинский журнал. 2014. №2 (46). С. 61-63. 

17.   Назаренко М.С., Марков А.В., Лебедев И.Н., Слепцов А.А., Макеева О. А. , Слепцов А. А.,  Кулиш Е. В.,  Барбараш О. Л., Мазур А.М., Прохорчук Е.Б., Чеканов Н.Н., Степанов В.А.,  Пузырев В. П. Геномное исследование коморбидности сердечно-сосудистого континуума // Acta Nature. 2015, Том 7 №3 (26), 99-110  PMID: 2648396 

18.   Назаренко М.С., Марков А.В., Слепцов А.А. Современные представления о молекулярно-генетических механизмах атерогенеза. // Молекулярно-биологические технологии в медицинской практике. ООО "Академиздат". Новосибирск. Выпуск 22 - 2015. Стр.56-68

19.   Гончарова И.А., Кучер А.Н, Тарасенко Н.В, Макеева О.А., Слепцов А.А. Брагина Е.Ю., Марков А.В., Пузырев В.П. Разработка панели генетических маркёров фиброгенеза и оценка её информативности для русского населения г.Томска. // Медицинская генетика. 2015  -№ 8 (158) - Т14 – С.7-12 

20.   Слепцов А.А., Назаренко М.С., Лебедев И.Н., Скрябин Н.А., Фролов А.В., Попов В.А., Барбараш О.Л., Барбараш Л.С., Пузырёв В.П. Соматическая вариабельность генома в тканях сосудистой стенки и лейкоцитах периферической крови при атеросклерозе // Генетика. 2014. №8. С. 986–995.  

21.   Марков А.В., Назаренко М.С., Королева Ю.А., Лебедев И.Н., Слепцов А.А., Фролов А.В., Попов А.В., Барбараш О.Л., Барбараш Л.С., Пузырев В.П. Уровень метилирования гена HOXD4 в тканях сосудистой стенки и лейкоцитах периферической крови у больных атеросклерозом // Медицинская генетика. 2014. № 1. С. 39-42.

22.   Пузырев В.П., Назаренко М.С., Лебедев И.Н., Марков А.В.,  Фролов А.В., Барбараш О.Л., Барбараш Л.С., Пузырев В.П. Профиль метилирования ДНК в тканях сосудистого русла при атеросклерозе // Молекулярная биология. 2013. Т. 47. № 3. С. 398-404.  

23.   Назаренко М.С., Марков А.В., Лебедев И.Н., Слепцов А.А., Королева Ю.А., Фролов А.В., Барбараш О.Л., Барбараш Л.С., Пузырев В.П. Профиль метилирования локуса INK4b-ARF-INK4a при атеросклерозе // Генетика. 2013. Т. 49. № 6. С. 783-787. 

24.   Назаренко М.С., Марков А.В., Лебедев И.Н., Слепцов А.А., Фролов А.В., Барбараш О.Л., Барбараш Л.С., Пузырев В.П. Статус метилирования генов клеточной пролиферации при атеросклерозе // Атеросклероз. 2013. Т. 9. № 1. С. 5-13.  2012-2011

25.   Слепцов А.А., Назаренко М.С., Назаренко Л. П., Сухомясова А. Л., Ноговицына А. Н., Максимова Н.Р., Гуринова Е. Е. Молекулярно-генетическое обследование больных с нарушением полового развития // Сибирский медицинский журнал (г. Томск), 2011. Т. 26. № 4-2. С. 201-203. 

26.   Назаренко М.С., Марков А.В., Слепцов А.А., Фролов А.В., Барбараш О.Л., Барбараш Л.С., Пузырев В.П. Статус метилирования гена CDKN2A (P16INK4A и P14ARF) в тканях сонных артерий у больных атеросклерозом // Медицинская генетика. 2012. Т. 11. № 2. С. 34-37. 

Учебно-методическое пособие:

1.      Назаренко М.С., Марков А.В., Слепцов А.А. Генетические аспекты атеросклероза // Учебно-методическое пособие. Серия «Наследственность и здоровье». Печатная мануфактура. Т.:2014 г., С.71, ISBN: 978-5-94476-296-2