Лебедев Игорь Николаевич
Лебедев Игорь Николаевич, доктор биологических наук, профессор РАН, врио директора НИИ медицинской генетики, заместитель директора по научной работе Томского НИМЦ, заместитель директора по научной работе НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ, руководитель лаборатории онтогенетики.
Контактная информация
e-mail: igor.lebedev@medgenetics.ru
тел. 8 (3822) 51-11-09
факс: 8 (3822) 51-37-44
Краткая биография
Родился в 1974 г. С отличием закончил в 1998 году магистратуру Биолого-почвенного факультета Томского государственного университета. С 1998 по 2001 год проходил обучение в аспирантуре НИИ медицинской генетики. С 2001 года являлся научным сотрудником лаборатории цитогенетики, а с 2005 года стал её руководителем. В 2001 году защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата биологических наук, а в 2008 году – диссертацию на соискание ученой степени доктора биологических наук по специальности «генетика». С 2015 года является заместителем директора по научной работе НИИ медицинской генетики. В 2016 году избран профессором РАН. С 2020 года – заместитель директора по научной работе Томского НИМЦ.
Область научных интересов
Основные научные работы И.Н. Лебедева посвящены исследованию вопросов цитогенетики индивидуального развития человека, изучению механизмов формирования хромосомных мутаций и установлению их роли в развитии наследственных болезней, разработке и внедрению в практику здравоохранения методов молекулярно-цитогенетической диагностики хромосомной патологии.
И.Н. Лебедев является автором и соавтором более 600 печатных трудов, в том числе – двух изданий «Национального руководства: Наследственные болезни» (М.: ГЭОТАР-Медиа, 2012, 2017), монографий «Регенеративная биология и медицина» (Омск – Москва – Томск, 2012, 2015, 2017), «Цитогенетические последствия радиационных и химических воздействий на человека» (Томск, 2014), «Плоскоклеточный рак головы и шеи: Молекулярные основы патогенеза» (М.: Наука, 2016), «Aneuploidy» (Karger, 2011), «Epigenetics and Epigenomics» (InTech, 2014), «Genetic information in practice» (Zagreb.: Medicinska Naklada, 2016). Под научным руководством И.Н. Лебедева защищены 9 кандидатских и 2 докторские диссертации.
Достижения, награды, гранты
Под руководством И.Н. Лебедева реализованы отечественные и международные исследовательские проекты, сфокусированные на анализе изменчивости генома человека в возникновении интеллектуальных нарушений, проблем репродукции, онкологических заболеваний. Описан ряд новых хромосомных мутаций при нарушениях эмбрионального развития и невынашивании беременности, исследованы молекулярно-генетические механизмы формирования хромосомных аномалий в онтогенезе, предложена классификация мозаичных форм хромосомных нарушений. В исследованиях, проведенных под руководством И.Н. Лебедева, впервые на явлениях геномного импринтинга и инактивации Х-хромосомы продемонстрирована роль нарушений эпигенетических механизмов регуляции активности генов при аномалиях эмбрионального развития человека. Разработаны и внедрены в практику отечественного здравоохранения передовые технологии пренатальной и преимплантационной генетической диагностики хромосомных заболеваний. Лебедев И.Н., выступая в качестве координатора с российской стороны в международном проекте 7 Рамочной программы Европейского союза, посвященном вопросам генетики недифференцированных форм умственной отсталости в детском возрасте, провел работы, направленные на установление роли хромосомных аномалий в этиологии интеллектуальных расстройств. В результате исследований описан ряд новых хромосомных мутаций, ассоциированных с задержкой интеллектуального развития ребенка. Впервые созданы клеточные модели заболеваний на основе аутологичных линий индуцированных плюрипотентных стволовых клеток от пациентов с хромосомными аберрациями. Под руководством Лебедева И.Н. проведен цикл научно-исследовательских работ, направленных на оценку параметров генетического здоровья работников атомной промышленности.
И.Н. Лебедев принимает активное участие в организации и проведении научных исследований при поддержке отечественных и зарубежных научных фондов – Российского научного фонда, Российского фонда фундаментальных исследований, Совета по Грантам Президента РФ, Федеральных целевых программ, 7 Рамочной Программы Европейского союза.
И.Н. Лебедев является членом диссертационного совета Д 002.279.04 по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук и ученой степени доктора наук по специальности 03.02.07 – генетика. Он также является членом Ученого совета ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук» и заместителем Председателя Ученого совета Научно-исследовательского института медицинской генетики Томского НИМЦ.
И.Н. Лебедев – член Президиума правления Российского общества медицинских генетиков, член Вавиловского общества генетиков и селекционеров, Европейской цитогенетической ассоциации, Европейского общества генетиков человека, Европейского общества репродукции человека и эмбриологии, эксперт Российского научного фонда. Является членом редакционных коллегий «Вавиловского журнала генетики и селекции» и «Journal of Assisted Reproduction and Genetics».
Научные достижения И.Н. Лебедева отмечены Почётными грамотами Администрации Томской области, грамотами СО РАМН, СО РАН, ТНЦ СО РАМН и профессиональных обществ. В 2016 году И.Н. Лебедев удостоен звания Лауреат Премии Томской области в сфере образования, науки, здравоохранения и культуры в номинации «Премии научным и научно-педагогическим работникам, внесшим значительный личный вклад в развитие науки и образования». В 2018 году отмечен Дипломом Комитета Государственной Думы РФ по здравоохранению.
Scopus AuthorID: 7103250270
https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=7103250270
Web of Science ResearcherID: K-7454-2012
https://publons.com/researcher/2684161/igor-n-lebedev
ORCID: 0000-0002-0482-8046
https://orcid.org/0000-0002-0482-8046
РИНЦ AuthorID: 96322
https://www.elibrary.ru/author_profile.asp?authorid=96322
Важнейшие публикации
Монографии и учебные пособия:
1. Дыгай А.М., Семченко В.В., Лебедев И.Н., Ерениев С.И., Степанов С.С., Леонтьев В.К., Ярыгин К.Н., Жданов В.В., Петровский Ф.И., Байматов В.Н., Назаренко М.С., Николаев Н.А. Регенеративная биология и медицина. Книга III. Клеточные технологии в медицине. - Коллективная монография / Под общей редакцией академика РАН В.П. Пузырёва, академика РАН А.М. Дыгая, профессора РАН И.Н. Лебедева и профессора В.В. Семченко. - Москва - Омск - Томск - Ханты-Мансийск: Омская типография. 2017. - 774 с.
2. Назаренко Л.П., Назаренко М.С., Салюкова О.А., Лебедев И.Н. Генетические аспекты интеллектуальных нарушений / Серия «Наследственность и здоровье»: учебное пособие под ред. В.П. Пузырёва. Вып. 14. – Томск: Литературное бюро, 2017. – 68 с.
3. Lebedev I.N. Cytogenetika probačaja (Cytogenetics of spontaneous abortions) / Genetičko informiranje u praksi (Genetic information in practice) (Eds. Čulič V., Pavelič J., Radman M.) / Zagreb.: Medicinska Naklada, 2016. 295 p.
5. Ярыгин К.Н., Семченко В.В., Ерениев С.И., Ярыгин В.Н., Степанов С.С., Дыгай А.М., Петровский И.Ф., Лебедев И.Н. Регенеративная биология и медицина. Книга II. Клеточные технологии в терапии болезней нервной системы / Под ред. В.Н. Ярыгина, В.П. Пузырёва, К.Н. Ярыгина и В.В. Семченко. – Екатеринбург – Москва – Омск – Томск – Ханты-Мансийск: Омская областная типография. 2015. – 360 с.
8. Lebedev I.N. Genomic imprinting and human reproduction // Epigenomics and Epigenetics. InTech. 2014.
10. Лебедев И.Н. Методы цитогенетической диагностики хромосомных болезней / Наследственные болезни: Национальное руководство / Под ред. Н.П. Бочкова, Е.К. Гинтера, В.П. Пузырёва. — М.: ГЭОТАР-Медиа, 2012.
11. Лебедев И.Н. Хромосомные болезни / Наследственные болезни: национальное руководство / Под ред. Н.П. Бочкова, Е.К. Гинтера, В.П. Пузырёва. — М.: ГЭОТАР-Медиа, 2012.
Статьи:
1. Nikitina T.V., Sazhenova E.A., Zhigalina D.I., Tolmacheva E.N., Sukhanova N.N., Lebedev I.N. Karyotype evaluation of repeated abortions in primary and secondary recurrent pregnancy loss // J. Assist. Reprod. Genet. 2020 37(3): 517-525. doi: 10.1007/s10815-020-01703-y
2. Fedorenko O.Yu., Golimbet V.E., Ivanova S.A., Levchenko A., Gainetdinov R.R., Semke A.V., Simutkin G.G., Gareeva A.E., Glotov A.G., Gryaznova A., Iourov I.Yu., Krupitsky E.M., Lebedev I.N., Mazo G.E., Kaleda V.G., Abramova L.I., Oleichik I.V., Nasykhova Yu.A., Nasyrova R.F., Nikolishin A.E., Kasyanov E.D., Rukavishnikov G.V., Timerbulatov I.F., Brodyansky V.M., Vorsanova S.G., Yurov Yu.B., Zhilyaeva T.V., Sergeeva A.V., Blokhina E.A., Zvartau E.E., Blagonravova A.S., Aftanas L.I., Bokhan N.A., Kekelidze Z.I., Klimenko T.P., Anokhina I.P., Khusnutdinova E.K., Klyushnik T.P., Neznanov N.G., Stepanov V.A., Schulze T.G., Kibitov A.O. Opening up new horizons for psychiatry genetics in the Russian Federation: moving toward a national consortium // Molecular Psychiatry. 2019 Aug;24(8):1099-1111. doi: 10.1038/s41380-019-0354-z https://www.nature.com/articles/s41380-019-0354-z
3. Shnaider TA, Pristyazhnyuk IE, Menzorov AG, Matveeva NM, Nikitina TV, Khabarova AA, Skryabin NA, Kashevarova AA, Lopatkina ME, Nazarenko LP, Lebedev IN, Serov OL. Generation of four IPSC lines from two siblings with a microdeletion at the CNTN6 gene and intellectual disability // Stem Cell Res. 2019 41:101591 doi: 10.1016/j.scr.2019.101591
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1873506119302211?via%3Dihub
4. Gridina MM, Nikitina TV, Pristyazhnyuk IE, Kashevarova AA, Lopatkina ME, Vasilyev SA, Nazarenko LP, Lebedev IN, Serov OL. Generation of the induced pluripotent stem cell line, ICAGi002-A, from unaffected carrier of megabase scaled duplication involving the CNTN6 gene // Stem Cell Res. 2019 40:101556. doi: 10.1016/j.scr.2019.101556
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1873506119301862?via%3Dihub
5. Kashevarova A.A., Nazarenko L.P., Skryabin N.A., Nikitina T.V., Vasilyev S.A., Tolmacheva E.N., Lopatkina M.E., Salyukova O.A., Chechetkina N.N., Vorotelyak E.A., Kalabusheva E.P., Fishman V.S., Kzhyshkowska J., Graziano C., Magini P., Romeo G., Lebedev I.N. A mosaic intragenic microduplication of LAMA1 and a constitutional 18p11.32 microduplication in a patient with keratosis pilaris and intellectual disability // Am J Med Genet A. 2018 Sep 23. doi: 10.1002/ajmg.a.40478. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/ajmg.a.40478
6. Čulić V., Lasan-Trcić R., Liehr T., Lebedev I.N., Pivić M., Pavelic J., Vulić R. A familial small supernumerary marker chromosome 15 associated with cryptic mosaicism with two different additional marker chromosomes derived de novo from chromosome 9: Detailed case study and implications for recurrent pregnancy loss // Cytogenet. Genome Res. 2018. 156(4): 179-184. doi: 10.1159/000494822
10. Nikitina T.V., Menzorov A.G., Kashevarova A.A., Gridina M.M., Khabarova A.A., Yakovleva Y.S., Lopatkina M.E., Kizilova E.A., Vasilyev S.A., Serov O.L., Lebedev I.N. Generation of two iPSC lines (IMGTi001-A and IMGTi001-B) from human skin fibroblasts with ring chromosome 22 // Stem Cell Res. 2018 31:244-248. doi: 10.1016/j.scr.2018.08.012.
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1873506118302046?via%3Dihub
11. Nikitina T.V., Menzorov A.G., Kashevarova A.A., Gridina M.M., Khabarova A.A., Yakovleva Y.S., Lopatkina M.E., Pristyazhnyuk I.E., Vasilyev S.A., Serov O.L., Lebedev I.N. Induced pluripotent stem cell line, IMGTi003-A, derived from skin fibroblasts of an intellectually disabled patient with ring chromosome 13 // Stem Cell Res. 2018 33:260-264. doi: 10.1016/j.scr.2018.11.009..
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1873506118302782?via%3Dihub
17. Kashevarova A.A., Nazarenko L.P., Schultz-Pedersen S., Skryabin N.A., Salyukova O.A., Chechetkina N.N., Tolmacheva E.N., Rudko A.A., Magini P., Graziano C., Romeo G., Joss Sh., Tümer Z., Lebedev I.N. Single gene microdeletions and microduplication of 3p26.3 in three unrelated families: CNTN6 as a new candidate gene for intellectual disability // Molecular Cytogenetics. 2014. 7:97. DOI: 10.1186/s13039-014-0097-0
22. Лопаткина М.Е., Лебедев И.Н. Транскриптомный анализ как инструмент изучения патогенеза хромосомных болезней // Генетика. 2020. Т. 56. № 5. С. 534-549 (Lopatkina M.E., Lebedev I.N. Transcriptome analysis as a tool for investigation of pathogenesis of chromosomal diseases // Russian Journal of Genetics. 2020. V. 56(5): 548-561).
23. Саженова Е.А., Никитина Т.В., Скрябин Н.А., Минайчева Л.И., Иванова Т.В., Немцева Т.Н., Юрьев С.Ю., Евтушенко И.Д., Лебедев И.Н. Эпигенетический статус импринтированных генов в плаценте при привычном невынашивании беременности // Генетика. 2017. Т. 53. № 3. С. 364-377 (Sazhenova E.A., Nikitina T.V., Skryabin N.A., Minaycheva L.I., Ivanova T.V., Nemtseva T.N., Yuriev S. Yu., Evtushenko I.D., Lebedev I.N. Epigenetic status of imprinted genes in placenta during recurrent pregnancy loss // Russian Journal of Genetics. 2017. V. 53. № 3. P. 376-387).
24. Жигалина Д.И., Скрябин Н.А., Артюхова В.Г., Светлаков А.В., Лебедев И.Н. Преимплантационная генетическая диагностика на основе бластоцентеза: проблемы и перспективы // Генетика. 2016. Т. 52. № 1. С. 5-13 (Zhigalina D.I., Skryabin N.A., Artyukhova V.G., Svetlakov A.V., Lebedev I.N. Preimplantation genetic diagnosis by blastocentesis: problems and perspectives // Russian Journal of Genetics. 2016. V. 52. № 1. P. 1-7).
25. Кашеварова А.А., Лебедев И.Н. Геномная архитектура хромосомных болезней человека // Генетика. 2016. Т. 52. № 5. С. 511-528 (Kashevarova A.A., Lebedev I.N. Genomic architecture of human chromosomal diseases // Russian Journal of Genetics. 2016. V. 52(5). P. 447-462).
26. Никитина Т.В., Лебедев И.Н. Цитогенетика привычного невынашивания беременности // Генетика. 2014. Т. 50. № 5. С. 501-514 (Nikitina T.V., Lebedev I.N. Cytogenetics of recurrent pregnancy loss // Russian Journal of Genetics. 2014. V. 50. № 5. P. 435-446).
27. Саженова Е.А., Скрябин Н.А., Суханова Н.Н., Лебедев И.Н. Мультилокусные эпимутации импринтома при патологии эмбрионального развития человека // Молекулярная биология. 2012. Т. 46. № 2. С. 204-213 (Sazhenova E.A., Skryabin N.A., Sukhanova N.N., Lebedev I.N. Multilocus epimutations of imprintome in the pathology of human embryo development // Molecular Biology. 2012. V. 46. № 2. P. 183-191).
28. Лебедев И.Н., Саженова Е.А. Эпимутации импринтированных генов в геноме человека: классификация, причины возникновения, связь с наследственной патологией // Генетика. 2008. Т. 44. № 10. С. 1356-1373 (Lebedev I.N., Sazhenova E.A. Epimutations of imprinted genes in the human genome: classification, causes, association with hereditary pathology // Russian Journal of Genetics. 2008. V. 44. № 10. P. 1176-1190).
29. Лебедев И.Н., Пузырёв В.П. Эпигенетические аспекты вспомогательных репродуктивных технологий // Генетика. 2007. Т. 43. № 9. С. 1157-1171 (Lebedev I.N., Puzyrev V.P. Epigenetic perspectives of safety in assisted reproductive technologies // Russian Journal of Genetics. 2007. V. 43. № 9. P. 961-972).
30. Лебедев И.Н., Назаренко С.А. Тканеспецифичный хромосомный мозаицизм по аутосомным трисомиям у спонтанных абортусов человека: механизмы формирования и фенотипические эффекты // Генетика. 2001. Т. 37. № 11. С. 1459-1474 (Lebedev I.N., Nazarenko S.A. Tissue-specific placental mosaicism for autosomal trisomies in human spontaneous abortuses: mechanisms of formation and phenotypical effects // Russian Journal of Genetics. 2001. V. 37. № 11. P. 1224-1237).