Персоналии

Голубенко Мария Владимировна

Голубенко Мария Владимировна, кандидат биологических наук (1998), старший научный сотрудник лаборатории популяционной генетики Научно-исследовательского института медицинской генетики Томского НИМЦ.

Контактная информация

Тел. +7-3822-517272
Факс +7-3822-513744
e-mail: maria.golubenko@medgenetics.ru

Краткая биография

В 1996 г. окончила с отличием биолого-почвенный факультет Томского государственного университета (кафедра цитологии и генетики, кафедра прикладной информатики). В НИИ медицинской генетики работает с 1996 г., в должности старшего научного сотрудника – с 2008 г. В 1998 г. защитила кандидатскую диссертацию.

Научные интересы

Основные интересы связаны с митохондриальной генетикой: изучение популяционного полиморфизма мтДНК человека, роль мтДНК в развитии многофакторных заболеваний. Кроме того, в область научных интересов входят генетика кардиомиопатии, генетика многофакторных заболеваний (в основном сердечно-сосудистых), популяционная и эволюционная генетика.

Достижения, награды, гранты

М.В. Голубенко является руководителем и исполнителем различных грантовых проектов, в частности:

• руководитель гранта РНФ № 04-04-00527 «Изменчивость митохондриальной ДНК человека, фенотип ишемической болезни сердца и риск развития нарушений сердечного ритма»;

• руководитель грантов РФФИ №19-04-01322а «Оценка адаптивности популяционного полиморфизма митохондриальной ДНК человека», №16-04-01481а «Эпигенетическое взаимодействие митохондриального и ядерного геномов при атеросклерозе», №07-04-01526a «Оценка вклада полиморфизма митохондриальной ДНК в формирование фенотипа сердечно-сосудистой системы у человека», №04-04-48792a «Характеристика митохондриального генофонда популяций народов Сибири с учетом современных миграционных процессов»;

• руководитель государственных контрактов ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техники» на 2002-2006 годы»: №02.442.11.7076 «Описание вариабельности гена-кандидата гипертрофической кардиомиопатии (MYBPC3) в популяциях человека различного этнического происхождения» и №02.442.11.7350 «Изучение вклада полиморфизма митохондриальной ДНК человека в изменчивость показателей состояния сердечно-сосудистой системы в норме и патологии»; государственного контракта ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры для инновационной России» №П977 от 20.08.2009 «Разработка олигонуклеотидных биосенсоров для определения вариантов генома с фармакогенетическим эффектом при сердечно-сосудистых заболеваниях».

Награждена почетными грамотами мэрии г. Томска за вклад в развитие томской науки (2006, 2008), грамотой СО РАМН за вклад в развитие медицинской генетики (2007). Лауреат Премии МАИК в области биологии коллективу авторов за цикл статей «Изучение молекулярно-генетических основ сердечно-сосудистых заболеваний» (2013). 

Основные публикации

1. Голубенко М.В., Пузырев В.П. Вольности генома: инсерции фрагментов митохондриальной ДНК в ядерный геном // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2024, т. 28, № 4.
2. Афанасьев С.А., Корепанов В.А., Бабушкина Н.П., Реброва Т.Ю., Муслимова Э.Ф., Голубенко М.В., Гарганеева А.А., Атабеков Т.А. Функциональная состоятельность митохондрий и полиморфизм митохондриального генома как факторы, влияющие на аритмогенез при хронической ишемической болезни сердца // Вестник аритмологии, 2024, Т. 31, № 1(115), с. 71-76. https://elibrary.ru/item.asp?id=61280065
3. Golubenko M.V., Pavlyukova E.N., Salakhov R.R., Makeeva O.A., Puzyrev K.V., Glotov O.S., Puzyrev V.P., Nazarenko M.S. A New Leu714Arg Variant in the Converter Domain of MYH7 is Associated with a Severe Form of Familial Hypertrophic Cardiomyopathy. Front Biosci (Schol Ed). 2024 Feb 23;16(1):1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38538344/
4. Salakhov R.R., Golubenko M.V., Valiakhmetov N.R., Pavlyukova E.N., Zarubin A.A., Babushkina N.P., Kucher A.N., Sleptcov A.A., Nazarenko M.S. Application of Long-Read Nanopore Sequencing to the Search for Mutations in Hypertrophic Cardiomyopathy // Int J Mol Sci. 2022, Dec 13;23(24):15845. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36555486/
5. Голубенко М.В., Зарубин А.А., Бабушкина Н.П., Тарасенко Н.В., Салахов Р.Р., Назаренко М.С. Характеристика спектра миссенс-замен в митохондриальных генах субъединиц НАДН дегидрогеназы для гаплогрупп мтДНК, распространенных в Северной Евразии. Медицинская генетика, 2022. Т. 21. № 12. С. 36-39. https://elibrary.ru/item.asp?id=49942461
6. Голубенко М.В., Шумакова Т.В., Макеева О.А., Тарасенко Н.В., Салахов Р.Р., Шипулин В.М., Назаренко М.С. Полиморфизм митохондриальной ДНК и ишемия миокарда: ассоциация гаплогруппы Н с сердечной недостаточностью. Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины, 2021, № 4, с. 70-77. https://elibrary.ru/item.asp?id=47489127
7. Салахов Р.Р., Голубенко М.В., Павлюкова Е.Н., Кучер А.Н., Бабушкина Н.П., Валиахметов Н.Р., Марков А.В., Беляева Е.О., Канев А.Ф., Назаренко М.С. Опыт молекулярно-генетической диагностики гипертрофической кардиомиопатии с использованием нанопорового секвенирования ДНК // Российский кардиологический журнал, 2021, т. 26, № 10, с. 36-41. https://elibrary.ru/item.asp?id=47208184
8. Панов А.В., Голубенко М.В., Даренская М.А., Колесников С.И. Происхождение митохондрий и их роль в эволюции жизни и здоровья человека // Acta Biomedica Scientifica, 2020, Vol. 5, N 5, с.12-25. https://elibrary.ru/item.asp?id=44164269
9. Голубенко М.В., Салахов Р.Р., Цепокина А.В., Афанасьев С.А., Муслимова Э.Ф., Реброва Т.Ю., Арчаков Е.А., Борисова Е.В., Баталов Р.Е., Максимов В.Н., Иванова А.А., Гуражева А.А., Орлов П.С., Бабушкина Н.П., Зарубин А.А., Понасенко А.В., Назаренко М.С., Пузырев В.П. изменчивость митохондриального генома при внезапной сердечной смерти // Медицинская генетика, 2020, Т. 19, № 5 (214), с. 31-32. https://elibrary.ru/item.asp?id=44061484
10. Салахов Р.Р., Голубенко М.В., Павлюкова Е.Н., Марков А.В., Бабушкина Н.П., Канев А.Ф., Валиахметов Н.Р., Назаренко М.С. Применение технологии мономолекулярного секвенирования для ДНК-диагностики гипертрофической кардиомиопатии //Медицинская генетика, 2020, Т. 19, № 5 (214), с. 9-10. https://elibrary.ru/item.asp?id=44061475
11. Golubenko M., Mikhailov V., Rusinova V., Shestak A., Zaklyazminskaya E. Lack of association between mitochondrial DNA haplogroups J and T and clinical manifestation in Russian patients with Brugada syndrome. Biomed Rep. 2020 Sep;13(3):16. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32765855/
12. Голубенко М.В., Бабушкина Н.П., Зарубин А.А., Салахов Р.Р., Макеева О.А., Маркова В.В., Афанасьев С.А., Понасенко А.В., Пузырев В.П. Ассоциация вариантов гаплогруппы Н1 митохондриальной ДНК с риском сердечно-сосудистых катастроф // Научные результаты биомедицинских исследований. 2019, Т. 5, № 4, с. 19-31. https://elibrary.ru/item.asp?id=41599964
13. Рыжкова О.П., Кардымон О.Л., Прохорчук Е.Б., Коновалов Ф.А., Масленников А.Б., Степанов В.А., Афанасьев А.А., Заклязьминская Е.В., Ребриков Д.В., Савостьянов К.В., Глотов А.С., Костарева А.А., Павлов А.Е., Голубенко М.В., Поляков А.В., Куцев С.И. Руководство по интерпретации данных последовательности ДНК человека, полученных методами массового параллельного секвенирования (MPS) (редакция 2018, версия 2) // Медицинская генетика, 2019, Т. 18, № 2, с. 3-23. https://elibrary.ru/item.asp?id=37256392
14. Голубенко М.В., Салахов Р.Р., Шумакова Т.В., Буйкин С.В., Макеев О.А., Назаренко М.С., Пузырев В.П. Полиморфизм митохондриальной ДНК и заболевания сердечно-сосудистого континуума // Медицинская генетика, 2018, Т. 17, № 1, С. 9-13. https://elibrary.ru/item.asp?id=32660665
15. Афанасьев С.А., Голубенко М.В., Цапко Л.П., Пузырев В.П. Полиморфизм митохондриальной ДНК в патогенетике внезапной сердечной смерти (обзор литературы) // Сибирский научный медицинский журнал, 2018, Т. 38, № 6, с. 49-56. https://elibrary.ru/item.asp?id=36534237
16. Sahakyan H, Hooshiar Kashani B, Tamang R, Kushniarevich A, Francis A, Costa MD, Pathak AK, Khachatryan Z, Sharma I, van Oven M, Parik J, Hovhannisyan H, Metspalu E, Pennarun E, Karmin M, Tamm E, Tambets K, Bahmanimehr A, Reisberg T, Reidla M, Achilli A, Olivieri A, Gandini F, Perego UA, Al-Zahery N, Houshmand M, Sanati MH, Soares P, Rai E, Šarac J, Šarić T, Sharma V, Pereira L, Fernandes V, Černý V, Farjadian S, Singh DP, Azakli H, Üstek D, Ekomasova Trofimova N, Kutuev I, Litvinov S, Bermisheva M, Khusnutdinova EK, Rai N, Singh M, Singh VK, Reddy AG, Tolk HV, Cvjetan S, Lauc LB, Rudan P, Michalodimitrakis EN, Anagnou NP, Pappa KI, Golubenko MV, Orekhov V, Borinskaya SA, Kaldma K, Schauer MA, Simionescu M, Gusar V, Grechanina E, Govindaraj P, Voevoda M, Damba L, Sharma S, Singh L, Semino O, Behar DM, Yepiskoposyan L, Richards MB, Metspalu M, Kivisild T, Thangaraj K, Endicott P, Chaubey G, Torroni A, Villems R. Origin and spread of human mitochondrial DNA haplogroup U7. Sci Rep. 2017 Apr 7;7:46044. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28387361/
17.  Pankratov V., Litvinov S., Kassian A., Shulhin D., Tchebotarev L., Yunusbayev B., Möls M., Sahakyan H., Yepiskoposyan L., Rootsi S., Metspalu E., Golubenko M., Ekomasova N., Akhatova F., Khusnutdinova E., Heyer E., Endicott P, Derenko M., Malyarchuk B., Metspalu M., Davydenko O., Villems R., Kushniarevich A. East  Eurasian ancestry in the middle of Europe: genetic footprints of Steppe nomads in the genomes of Belarusian Lipka Tatars // Sci Rep. 2016 Jul 25;6:30197. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4958967/
18. Голубенко М.В., Назаренко М.С., Фролов А.В., Слепцов А.А., Марков А.В., Глушкова М.Е., Барбараш О.Л., Пузырев В.П. Анализ гетероплазмии в главной некодирующей области митохондриальной ДНК в крови и атеросклеротических бляшках сонных артерий // Генетика, 2016. Т. 52. №4. С.497-502. http://elibrary.ru/item.asp?id=25922075
19. Голубенко М.В., Салахов Р.Р., Макеева О.А., Гончарова И.А., Кашталап В.В., Барбараш О.Л., Пузырев В.П. Ассоциации полиморфизма митохондриальной ДНК с инфарктом миокарда и прогностически значимыми признаками атеросклероза // Молекулярная Биология, 2015. Т. 49. №6. С. 968-976. http://elibrary.ru/item.asp?id=24730417
20. Макеева О.А., Зыков М.В., Голубенко М.В., Кашталап В.В., Кулиш Е.В., Гончарова И.А., Барбараш О.А., Пузырев В.П. Роль генетических факторов в прогнозировании осложнений на протяжении года после инфаркта миокарда // Кардиология, 2013, №10, с. 16-23. http://elibrary.ru/item.asp?id=20862065
21. Жейкова Т.В., Голубенко М.В., Буйкин С.В., Боткина О.Ю., Цимбалюк И.В., Максимов В.Н., Воевода М.И., Пузырев В.П. Анализ ассоциаций полиморфного локуса 242 C>T гена субъединицы p22phox НАДФН-оксидазы (CYBA) с долгожительством в российской популяции // Генетика, 2013, т. 49, № 3, с. 410-414. http://elibrary.ru/item.asp?id=18797100
22. Жейкова Т.В., Голубенко М.В., Буйкин С.В., Боткина О.Ю., Макеева О.А., Лежнев А.А., Калянов Е.В., Цимбалюк И.В., Максимов В.Н., Воевода М.И., Шипулин В.М., Пузырев В.П. Полиморфизм Pro198→Leu  гена глутатионпероксидазы (GPX1): связь с продолжительностью жизни и ишемической болезнью сердца // Молекулярная Биология, 2012, т.46, №3, с. 481-486. http://elibrary.ru/item.asp?id=17726073
23. Жейкова Т.В., Голубенко М.В., Буйкин С.В., Макеева О.А., Лежнев А.А., Цимбалюк И.В., Шипулин В.М., Пузырев В.П.   Ассоциация полиморфизма Thr12Ser гена митохондриального фактора транскрипции А TFAM с ишемической болезнью сердца // Бюллетень сибирской медицины, 2012, №6, с. 47-50. http://elibrary.ru/item.asp?id=18779180
24. Жейкова Т.В., Голубенко М.В., Буйкин С.В., Макеева О.А., Лежнев А.А., Цимбалюк И.В., Шипулин В.М., Пузырев В.П. Ассоциация полиморфиза Ala16Val  гена супероксиддисмутазы 2 (SOD2) с ишемической болезнью сердца у мужчин в российской популяции // Сибирский медицинский журнал, 2012, т. 27, № 4, с. 34-37. http://elibrary.ru/item.asp?id=19065739
25. Буйкин С.В., Голубенко М.В., Пузырев В.П. Участие “митохондриальных генов” в формировании артериальной гипертонии и гипертрофии левого желудочка // Молекулярная Биология, 2010, т. 44, №1, с.28-32. http://elibrary.ru/item.asp?id=13044323
26. Kaput J1, Cotton RG, Hardman L, Watson M, Al Aqeel AI, Al-Aama JY, Al-Mulla F, Alonso S, Aretz S, Auerbach AD, Bapat B, Bernstein IT, Bhak J, Bleoo SL, Blöcker H, Brenner SE, Burn J, Bustamante M, Calzone R, Cambon-Thomsen A, Cargill M, Carrera P, Cavedon L, Cho YS, Chung YJ, Claustres M, Cutting G, Dalgleish R, den Dunnen JT, Díaz C, Dobrowolski S, dos Santos MR, Ekong R, Flanagan SB, Flicek P, Furukawa Y, Genuardi M, Ghang H, Golubenko MV, et al.  Planning the human variome project: the Spain report. Human  Mutation, 2009 Vol. 30, No. 4,  P. 496-510. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/humu.20972/abstract;jsessionid=B92FD60B3C43066CBA5A38C6165F1B79.f01t04
27. Tamm E., Kivisild T., Reidla M., Metspalu M., Smith D.G., Mulligan C.J., Bravi C.M., Rickards O., Martinez-Labarga C., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A., Golubenko M.V., Stepanov V.A., Gubina M.A., Zhadanov S.I., Ossipova L.P., Damba L., Voevoda M.I., Dipierri J.E., Villems R., Malhi R.S. Beringian standstill and spread of Native American founders. PLoS ONE. 2007 Sep 5;2(9):e829. http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0000829
28. Пузырёв В.П., Макеева О.А., Голубенко М.В. Гены синтропий и сердечно-сосудистый континуум // Вестник ВОГиС. – 2006. – Т.10. - №3. – С.479-491. http://elibrary.ru/item.asp?id=9573993
29. Буйкин С.В., Голубенко М.В., Погребенкова В.В., Цимбалюк И.В., Пузырев В.П.  Ген POLG митохондриальной γ-полимеразы: частота и анализ сцепления двух однонуклеотидных замен (SNP) в популяциях народов Сибири // Молекулярная биология. – 2006. – Т.40. - №6. - С. 1081-1083. http://elibrary.ru/item.asp?id=9448977
30. Loogväli EL, Roostalu U, Malyarchuk BA, Derenko MV, Kivisild T, Metspalu E, Tambets K, Reidla M, Tolk HV, Parik J, Pennarun E, Laos S, Lunkina A, Golubenko M., Barac L, Pericic M, Balanovsky OP, Gusar V, Khusnutdinova EK, Stepanov V, Puzyrev V, Rudan P, Balanovska EV, Grechanina E, Richard C, Moisan JP, Chaventré A, Anagnou NP, Pappa KI, Michalodimitrakis EN, Claustres M, Gölge M, Mikerezi I, Usanga E, Villems R. Disuniting uniformity: a pied cladistic canvas of mtDNA haplogroup H in Eurasia. Molecular  Biology and Evolution. 2004. V.21(11). P. 2012-2021. http://mbe.oxfordjournals.org/content/21/11/2012.long
31. Waldmueller S., Sakthivel S., Saadi A.V., Selignow C., RAkesh P.G., Golubenko M., Joseph P.K., Padmakumar R., Richard P., Schwarz K., Tharakan  J.M., Rajamanikam C., Vosberg H-P. Novel deletions in MYH7 and MYBPC3 identified in Indian families with familial hyperthrophic cardiomyopathy. // Journal of Molecular and Cellular Cardiology, 2003. V. 35. P. 623-636. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022282803000506
32. Пузырев В.П., Степанов В.А., Голубенко М.В., Пузырев К.В., Максимова Н.Р., Харьков В.Н., Спиридонова М.Г., Ноговицина А.Н. Линии мтДНК и Y-хромосомы в популяции якутов // Генетика, 2003. Т. 39. № 7. С.975-981. http://elibrary.ru/item.asp?id=17351468
33. Голубенко М.В., Макеева О.А, Пузырев К.В., Павлюкова Е.Н., Пузырев В.П. Исследование полиморфизма генов тяжелой цепи бета-миозина (MYH7) и миозинсвязывающего белка С (MYBPC3) при гипертрофической кардиомиопатии и эссенциальной гипертензии // Медицинская Генетика, 2003, т.2. №1. С.35-40. https://elibrary.ru/item.asp?id=42481694
34. Reidla M., Kivisild T., Metspalu E., Kaldma K., Tambets K., Tolk H-V, Parik J., Loogvali E-L.., Derenko M.V., Malyarchuk B.A., Bermisheva M., Zhadanov S., Pennarun E., Gubina M., Golubenko M., Damba L., Fedorova S., Gusar V., Mikerezi I., Moisan J.P., Khusnutdinova E., Ossipova L., Stepanov V., Voevoda M., Achilli A., Rengo C.,  Rickards O., De Stefano G.F., Papiha S., Beckman L., Rudan P., Anagnou N.P., Koziel S., Usanga E., Geberhiwot T., Herrnstadt C.J., Torroni A., Villems R. The global topology of human haplogroup X and its phylogeography. // American Journal of Human Genetics, 2003. - Nov; Vol.73, No.6. – P. 1178-1190. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1180497/
35. Голубенко М.В., Пузырев К.В., Павлюкова Е.Н., Макеева О.А., Пузырев В.П., Карпов Р.С. Изменчивость гена MYH7 при гипертрофической кардиомиопатии: ассоциация SNP с фенотипом // Медицинская Генетика, 2002. Т.1. №1. С.42-44. http://elibrary.ru/item.asp?id=25005713
36. Голубенко М.В., Пузырев В.П., Салюков В.Б., Кучер А.Н., Санчат Н.О. Анализ распространенности «монголоидных» гаплогрупп митохондриальной ДНК среди коренного населения Тувы // Генетика, 2001. Т. 37. № 6, с.831-839. http://elibrary.ru/item.asp?id=14957620
37.    Пузырев В.П., Голубенко М.В., Фрейдин М.Б. Сфера компетенции митохондриальной генетики // Вестник РАМН, 2001. № 10, с.31-37. https://elibrary.ru/item.asp?id=41480863
38. Фрейдин М.Б., Пузырев В.П., Салюков В.Б., Голубенко М.В. Связь полиморфизма некодирующих областей митохондриального генома человека с изменчивостью уровня артериального давления и величин интервальных оценок ЭКГ // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 1999, т.127, Прил. 1. С. 82-84. http://elibrary.ru/item.asp?id=25825787
39. Голубенко М.В., Пузырев В.П., Салюков В.Б. Кучер А.Н. Санчат Н.О. Рестрикционный полиморфизм главного некодирующего района мтДНК  у коренного населения Республики Тува // Генетика. – 1999. – Т.35. – № 8. – С. 1124-1131. http://elibrary.ru/item.asp?id=25825787